细胞中所有的生活物质称为原生质（protoplasm）。植物细胞除去细胞壁而得到的原生质球状体称为原生质体。原生质体主要由细胞质（cytoplasm）、细胞核（nucleus）和液泡（vacuole）组成。
　　1.细胞质
　　细胞质的成分包括质膜、细胞质基质、内膜系统、细胞骨架、核糖体、线粒体和质体等。
　　（1）细胞质基质。细胞质在光学显微镜下，它是均匀一致的透明质；在电镜下，可看到许多不同类型的细胞器，细胞质除去这些细胞器，就是细胞质基质（cytoplasmicmatrix），亦称细胞浆（cytosol）。从生物化学的角度讲，它是细胞质的可溶相，是经过超速离心后所留下的上清液部分。细胞质基质的化学成分有水、无机离子、溶解的气体、糖类、脂类、氨基酸、核苷酸、蛋白质和RNA等。
　　过去认为细胞质基质是无色透明均一的胶体物质。但通过研究，现在发现细胞质基质也存在一些亚显微结构。在电镜下，可看到细胞质基质含有许多纤维，这些纤维维持细胞的形态和运动，也提供细胞器的固着点。这些纤维包括微管、微丝和中间纤维。它们都是蛋白质，并相互联结成主体的网络，形成所谓细胞骨架（cytoskeleton），称为微梁系统（microtubule system）。
　　蛋白质是细胞质基质的主要成分，因此细胞质基质具有胶体性质，如界面扩大、亲水性以及溶胶化与凝胶化等性质。一般情况下，植物细胞的原生质呈溶胶状态，在环境条件改变时，可由溶胶变为凝胶状态，比如，休眠的种子和芽的原生质呈凝胶状态。
　　细胞质基质是植物细胞进行代谢活动的重要场所，比如，呼吸代谢的糖酵解、磷酸戊糖途径，脂肪的分解与脂肪酸的合成，光合细胞的蔗糖合成，硝酸盐的还原以及C4植物叶肉细胞固定二氧化碳等都是在细胞质基质中进行的；由核糖体合成的许多蛋白质亦在此进行。另外，细胞质基质可提供细胞器所需要的离子环境和反应底物。细胞质基质的的流动有利于物质的吸收和运转。
　　（2）膜系统。膜系统包括质膜和内膜。质膜包围着细胞质，它调节物质进出细胞，参与调控植物代谢和生长发育中的许多过程，具有很重要的意义。内膜系统包括内质网、高尔基体、核膜、液泡膜、微体和溶酶体等。
　　内质网（endoplasmic reticulum，ER）是由一层单位膜构成的囊状、泡状和管状的网膜系统。根据其膜外表面有无核糖体存在，可分为粗糙内质网和光滑内质网两种类型。内质网与核膜相连通，并与高尔基体在结构与功能上有密切关系。粗糙内质网可合成蛋白质。光滑内质网除有运输由粗糙内质网所合成的蛋白质的功能外，还可合成脂类和固醇。内质网还是细胞内和细胞间物质与信息交流或运输的通道。
　　高尔基体（Golgibody）是由许多扁平的囊泡构成、包着单层膜的细胞器，意大利学者C.Golgi于1898年发现，故名。它位于内质网和质膜之间。高尔基体与细胞的分泌机能有关，能够收集和排出内质网所合成的物质，它也是凝聚某些酶原颗粒的场所。高尔基体还参与多糖和糖蛋白的合成，因此与细胞壁和细胞膜的形成有关。
　　核膜是细胞核与细胞质之间的界膜，由两层膜构成。其外膜与内质网有相连部位，可进行物质交换。核膜上有许多核孔，蛋白质。核酸等大分子可从中通过。
　　液泡膜是包着液泡的单层膜，可控制液泡中溶质的进出，从而调节细胞的水势。
　　微体（microbody）是由单层膜包裹成的球状细胞器，是由内质网的小泡形成的，主要有过氧化体和乙醛酸体。过氧化体与叶绿体和线粒体一道完成光呼吸作用。乙醛酸体能将脂肪酸转变为糖类。
　　溶酶体（lysosome）是泡状结构，外面包着一层单位膜，其内部没有特殊的结构，含有能够水解糖类、脂类、蛋白质与核酸等几十种酸性水解酶类。溶酶体是细胞内溶解大分子物质的细胞器，它既可分解由外界进入细胞的物质，如分解异物，消除病菌等；也可消化细胞内原来存在的物质，如解体的线粒体和其他细胞器的碎片。因此它具有防御与营养的功能。
　　（3）线粒体。线粒体（mitochondrion）是由双层膜组成的囊状结构，其形状、大小随细胞类型和生理状态而变化，一般呈球状、杆状或管状，长径约1～5μm，短径约1.5～1.0μm。线粒体的外膜平滑；内膜向内皱褶伸入而成为嵴，使其表面积大大增加，有利于呼吸过程中的酶促反应。内膜所包围的物质，称为基质或介质，呈透明胶体状，化学成分主要有可溶性蛋白、脂类、核糖体、核酸和多种酶。在内膜上，分布着许多颗粒，这些颗粒与ATP的合成有关（图1—6）。
　　线粒体的外膜含磷脂多，通透性大，物质容易进出。内膜含蛋白质较多，通透性小，有利于一些酶促反应的进行，离子和分子的通过要有特殊的载体帮助才行。
　　线粒体是细胞进行呼吸作用的主要场所。已经证明，三羧酸循环、氨基酸代谢和脂肪酸分解中的各种酶存在于线粒体基质中；而电子传递和氧化磷酸化的酶系则存在于线粒体的内膜上。线粒体基质中还含有DNA、RNA及合成蛋白质所需的各种酶，可合成蛋白质。